GM Abstract Scan 改

PubMed AI 検索 Google DeepMind Gemma 4 Version

取り扱い説明書 インデックス検索

1 概要とシステム構成

GM Abstract Scan 改 は、Google DeepMind のオープンウェイト大規模言語モデル Gemma 4 を用いた PubMed(米国国立医学図書館の文献データベース)検索・分析アプリケーションです。 自然文や単語から PubMed 検索式を自動生成し、取得したアブストラクトを AI が日本語で要約・分析します。
Gemma 4 はフロンティアモデルに匹敵する性能を持ちながら、消費者向け GPU に搭載可能なモデルです。

主な機能

処理の流れ

ユーザー入力
(自然文・単語)
Gemma 4
クエリ生成
PubMed
検索・取得
Gemma 4
個別要約
Gemma 4
報告書作成
(任意)
本ツールは研究室のサーバー上で動作する ローカル LLM(Gemma 4) を使用しています。 入力データはサーバー内で処理され、外部クラウドへは送信されません。 ただし PubMed へのクエリは NCBI の外部 API を経由します。

2 GM Abstract Scan(公開版)との違い

当社ホームページで公開している GM Abstract Scan は ChatGPT を使用しています。 本アプリケーションは Gemma 4 を採用し、ローカル環境に最適化しています。

項目 GM Abstract Scan GM Abstract Scan 改
使用 LLM ChatGPT(OpenAI) Gemma 4(Google)
個別要約件数 < 200 < 1000
報告書作成件数 < 200 50 件固定(個別要約から統合)
動作環境 外部クラウド API 研究室内ローカルサーバー
データの外部送信 あり(OpenAI サーバー) なし(PubMed API を除く)

3 クイックスタート

1

検索内容を入力する

「検索内容」欄に調査したいテーマを日本語または英語で入力します。単語でも文章でも構いません。

2

件数・条件を設定する

取得件数(最大 200 件推奨)とソート条件を選択します。

3

「検索」ボタンを押す

クエリ生成 → PubMed 検索 → アブストラクト取得 → 個別要約 までを一括で自動実行します。

4

(任意)「報告書作成」を押す

作成済みの個別要約 上位 50 件を統合し、約 2,000 字の日本語報告書を生成します。

5

結果を保存する

「ダウンロード」ボタンで分析結果を Markdown ファイル(.md)として保存します。

Markdown ファイルの閲覧:ブラウザ拡張機能 Markdown Viewer 推奨。その他 VS Code などのエディタ。

4 ① AI 検索・個別要約

検索内容の入力

「検索内容」テキストエリアに調査したい内容を入力します。 検索と無関係な内容(個人情報・雑談など)は入力しないでください。 日本語で入力した場合、AI が自動的に英語の PubMed 検索式に変換します。

検索オプション

項目説明
取得件数 PubMed から取得するアブストラクトの最大件数(1〜1,000 件)。200 件以下を推奨。
ソート条件 best match(既定):関連度順 / publication date:出版日順 / most recent:新着順

「検索」ボタンの動作(一括自動実行)

本バージョンでは「検索」ボタン 1 つで以下の処理を連続して自動実行します。 個別の操作は不要です。

① AI が PubMed 検索式(英語・MeSH タグ付き)を自動生成
② 生成されたクエリをログエリアに表示
③ PubMed eSearch で PMID リストを取得
④ PubMed eFetch でアブストラクト本文を取得
⑤ 取得したアブストラクトを 10 件ずつ AI で個別要約・表形式で出力
⑥ 個別要約を内部メモリに保存(報告書作成用)

個別要約の出力形式

個別要約は次の表形式で出力されます。

処理時間の目安:取得件数とサーバー負荷により異なりますが、 50 件の個別要約には数分程度かかります。処理中はボタンが無効化されます。

5 ② 報告書作成

2 段階構成について

本バージョンでは、個別要約の作成(① 検索ボタン)報告書の作成(② 報告書作成ボタン)が分離されています。 報告書はアブストラクト本文ではなく、個別要約の上位 50 件を根拠として統合生成されます。

STAGE 1

個別要約(自動)

「検索」ボタンで自動実行されます。取得した全アブストラクトを 10 件ずつ処理し、表形式の日本語要約を生成。

※ 個別要約はメモリに保存され、報告書作成の入力となります。

STAGE 2

報告書作成(任意)

「報告書作成」ボタンで実行。個別要約 上位 50 件を統合し、約 2,000 字の日本語報告書を生成。文中引用には PubMed ID を使用します。

※ 個別要約が存在しない場合は実行できません。

※ best match ソートとの組み合わせを推奨。

報告書の特徴

報告書作成の前に必ず「検索」を実行してください。 報告書は直前の検索で作成した個別要約に基づいて生成されます。 新たに検索を実行すると過去の個別要約は破棄されます。 ページを再読み込みするとすべてのデータが消えるため、再度「検索」から実行してください。

6 ボタン・UI リファレンス

ボタン機能
検索 クエリ生成・PubMed 取得・個別要約までを一括自動実行します。本バージョンの中核操作です。
報告書作成 「検索」で作成された個別要約 上位 50 件を統合し、約 2,000 字の報告書を生成します。
ダウンロード ログエリアの内容を Markdown ファイル(.md)として保存します。PubMed ID はリンク付きで出力されます。
コピー ログエリアのテキスト全体をクリップボードにコピーします。
クリア ログエリアの表示をクリアします。取得済みのアブストラクト・個別要約データはメモリ上に保持されます。

7 注意事項・免責

個人情報の取り扱い

個人情報を入力しないでください。
患者名・生年月日・住所・連絡先・診断情報など、個人を特定しうる情報は絶対に入力しないでください。 入力データはサーバー内で簡易個人情報フィルタ処理を経て LLM に送られますが、 フィルタは万全ではありません。

データの保存・消失について

入力データおよび処理結果はサーバー上に保存されません。 処理完了後、速やかにメモリから消失します。 ただし、ハッキングや不正アクセスによるデータ流出の可能性をゼロとは保証できません。 機密性の高い情報の入力はお控えください。

医療目的での使用について

本ツールは研究・情報収集を目的とした学術支援ツールであり、 医療診断・治療方針の決定・医学的助言を提供するものではありません。 AI による要約・解析の正確性・完全性は保証されません。 医療判断は必ず原著論文・専門家の見解・最新のガイドラインを参照してください。

PubMed・NCBI について

文献情報は PubMed (NCBI) から取得しています。本ツールは NCBI・米国国立医学図書館・NLM とは一切の提携・後援関係にありません。 著作権は各著者・出版社等に帰属します。アブストラクト本文の無断転載はお控えください。

出力の確認

AI が生成する要約・報告書には誤りが含まれる場合があります。 重要な情報については必ず PubMed リンクから原著論文を確認してください。 ダウンロードファイル中の PubMed ID はリンク付きで出力されます。